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血清N-聚糖生物标志物诊断ALT水平正常慢性乙型肝炎患者显著肝纤维化和肝硬化的临床意义 Article
王林, 刘艺琪, 顾启馨, 张驰, 徐蕾, 王蕾, 陈翠英, 刘学恩, 赵鸿, 庄辉
《工程(英文)》 2023年 第26卷 第7期 页码 151-158 doi: 10.1016/j.eng.2023.03.008
本研究目的是探讨血清N-聚糖模型在285例丙氨酸转移酶(alanine aminotransferase, ALT)水平正常的诊断效能优于肝硬度值测量(liver stiffness measurement, LSM)、基于4因子的纤维化指数(fibrosis index based on the four factors, FIB-4)和天冬氨酸转氨酶与血小板比率指数
口袋改造策略克服ω-氨基转移酶AtATA对1-乙酰基萘活性和稳定性之间的"trade-off"效应 Article
曹佳仁, 樊芳芳, 吕常江, 胡升, 赵伟睿, 梅家祺, 邱帅, 梅乐和, 黄俊
《工程(英文)》 2023年 第30卷 第11期 页码 203-214 doi: 10.1016/j.eng.2023.04.009
氨基转移酶是一种能够催化前手性酮或醛不对称胺化生成相应的手性胺的生物催化剂。因此,开发克服这种相互抵消的“trade-off”效应的普适方法以及获得高效催化的氨基转移酶具有重要意义。对此,我们针对土曲霉属氨基转移酶(AtATA)的底物结合口袋进行共进化改造,以确定控制AtATA对1-乙酰基萘活性和稳定性的关键氨基酸。与亲本酶AtATA_D224K(AtATAPa)相比,M4的催化效率(kcat/Km1-乙酰基萘最后,口袋工程策略也将增强的活性和热稳定性成功地转移到其他三个序列相似性介于8%~22%之间的氨基转移酶中。这项研究对于克服ATA活性和热稳定性之间的权衡具有重要意义。
关键词: “trade-off”效应 共进化 氨基转移酶 口袋改造
约束优化下的霍曼转移 None
Li XIE, Yi-qun ZHANG, Jun-yan XU
《信息与电子工程前沿(英文)》 2018年 第19卷 第11期 页码 1444-1458 doi: 10.1631/FITEE.1800295
关键词: 霍曼转移;非线性规划;约束优化;变分法
肠道菌群调控的色氨酸代谢改善了D-Gal/LPS诱导的C57BL/6小鼠急性肝衰竭 Article
郑志鹏, 伍莉, 韩玉秋, 陈俊, 朱帅, 姚圆圆, 王保红, 李兰娟
《工程(英文)》 2022年 第14卷 第7期 页码 134-146 doi: 10.1016/j.eng.2020.12.013
糖尿病发作后心脏脂蛋白脂肪酶的变化 Review
Chae Syng Lee, Yajie Zhai, Brian Rodrigues
《工程(英文)》 2023年 第20卷 第1期 页码 19-25 doi: 10.1016/j.eng.2022.06.013
通过蛋白质工程提高聚酯水解酶对PET 塑料的降解效率 Article
马渊, 姚明东, 李炳志, 丁明珠, 何博, 陈思, 周晓, 元英进
《工程(英文)》 2018年 第4卷 第6期 页码 888-893 doi: 10.1016/j.eng.2018.09.007
来自Ideonella sakaiensis 的聚对苯二甲酸乙二醇酯水解酶(PETase)在室温下具有很强的降解聚对苯二甲酸乙二醇酯(PET)的能力,因此被认为是解决聚酯塑料污染问题的潜在工具为了更加快速地筛选突变体酶的活性,本研究利用无细胞蛋白表达体系对设计的PETase 突变体进行高通量的表达和验证。最终发现三种突变体(R61A、L88F 和I179F)的酶活性相比野生型分别提高了1.4 倍、2.1 倍和2.5 倍。其中,I179F突变体的酶活性最高,降解效率为22.5 mg·μmol–1·d–1。因此,本研究通过蛋白质工程对PETase 的关键疏水位点进行设计和改造,获得了降解效果提高的酶突变体,并进一步证实了其生物降解塑料的潜力。
利用异源酶组合构建酿酒酵母中咖啡酸的生物合成 Article
刘岚清, 刘宏, 张伟, 姚明东, 李炳志, 刘夺, 元英进
《工程(英文)》 2019年 第5卷 第2期 页码 287-295 doi: 10.1016/j.eng.2018.11.029
低蛋白日粮中添加亮氨酸通过雷帕霉素靶蛋白信号通路增加成年大鼠骨骼肌重量及蛋白质合成
张博, 楚丽翠, 刘宏, 谢春元, 谯仕彦, 曾祥芳
《工程(英文)》 2017年 第3卷 第5期 页码 760-765 doi: 10.1016/J.ENG.2017.03.008
生物质制备纳米零价铁生物炭的铁相转移和原位还原机制 Article
卓胜男, 任宏宇, 谢国俊, 邢德峰, 刘冰峰
《工程(英文)》 2023年 第21卷 第2期 页码 124-134 doi: 10.1016/j.eng.2021.07.012
纳米零价铁生物炭(nZVI-BC)作为一种由废弃生物质制备的环境友好型材料,可有效解决生物质转化和环境污染问题。然而,复杂的生物质/生物炭改性过程阻碍了它们的进一步生产和应用。在本研究中,一种绿色溶剂聚乙二醇400(PEG400)被引入FeCl3⋅6H2O改性水稻秸秆(RS)的反应体系中,改性后的RS通过一步热解法被转化为nZVI-BC。PEG400 的添加促进了铁离子的水解并改善了RS的表面结构,有利于Fe2O3附着到RS表面。在60 ℃、80 ℃、100 ℃和0.5 h 的改性条件下,RS中木质素组分损失不多,有利于高温热解过程中碳骨架的形成。Fe2O3在热解产生的还原气体和无定形碳的帮助下被还原,最终形成nZVI-BC。将该方法制备的nZVI-BC 用于染料刚果红的催化高级氧化去除,结果表明,nZVI-BC 具有快速的吸附能力(5 min 时吸附效果为70.6%)和高效的催化降解能力(60 min 时催化降解90%)。本研究为nZVI-BC的制备提供了一种新的策略,为其规模化生产和应用奠定了基础。
外泌体CD44与整合素α6β4结合激活宿主细胞重塑肿瘤微环境促进胰腺癌恶性转移 Article
牟为, 许亚婕, 顾鹏飞, 王文斌, 李井泉, 葛阳, 王慧
《工程(英文)》 2021年 第7卷 第10期 页码 1415-1425 doi: 10.1016/j.eng.2020.08.013
酶法合成sn-2棕榈酸甘油酯的研究进展 Review
韦伟, 孙聪, 王小三, 金青哲, Xuebing Xu, Casimir C. Akoh, 王兴国
《工程(英文)》 2020年 第6卷 第4期 页码 406-414 doi: 10.1016/j.eng.2020.02.008
发生于胃和结直肠的印戒细胞癌的临床特征以及不同部位的转移对预后的预测价值的研究 Article
吴静静, 方戴琼, 满达, 吴文瑞, 王清, 李雅婷, 叶建中, 李兰娟
《工程(英文)》 2020年 第6卷 第9期 页码 1028-1034 doi: 10.1016/j.eng.2020.06.007
理性设计大幅提高一种丝孢堆黑粉菌来源脂肪酶催化活性——用于合成莫西沙星手性中间体 Article
蔡雪, 沈江伟, 强煜, 华婧, 马樟奇, 柳志强, 郑裕国
《工程(英文)》 2022年 第19卷 第12期 页码 207-216 doi: 10.1016/j.eng.2022.03.020
通过脂肪酶不对称拆分外消旋N-乙酰基-哌啶-2,3-二甲酸二甲酯[cis-(±)-1],在前期研究中,筛选得到了一株丝孢堆黑粉菌(SRL)来源的脂肪酶,该脂肪酶具有高热稳定性和pH值稳定性。但SRL来源的脂肪酶活性较低,无法满足工业化应用的需求。因此本研究依据前期南极假丝酵母来源脂肪酶B(CALB)改造策略,采用理性设计方法对SRL进行定点突变改造,获得一个双突变体SRLI194N/V195L。总体而言,研究发现了一株对cis-(±)-1 (S,S)-2,8-二氮杂双环壬烷具有高催化活性、严格立体选择性的脂肪酶,可应用于工业化生产,并为其他具有相似结构的脂肪酶和其他种类酶的活性提高提供了一种通用策略。
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